Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHBP07195 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHBP07195 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHBP07195 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHBP07195 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHBP07195 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHBP07195 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHBP07195 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHBP07195 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHBP07195 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHBP07195 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDHBP07195 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHBP07195 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHBP07195 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHBP07195 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHBP07195 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHBP07195 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHBP07195 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHBP07195 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHBP07195 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHBP07195 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHBP07195 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHBP07195 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHBP07195 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDHBP07195 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDHBP07195 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHBP07195 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHBP07195 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHBP07195 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHBP07195 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHBP07195 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHBP07195 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHBP07195 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHBP07195 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDHBP07195 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDHBP07195 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDHBP07195 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms