Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms