Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms