Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4P02776 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4P02776 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4P02776 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4P02776 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4P02776 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4P02776 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4P02776 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4P02776 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PF4P02776 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4P02776 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PF4P02776 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PF4P02776 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PF4P02776 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4P02776 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PF4P02776 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PF4P02776 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PF4P02776 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PF4P02776 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PF4P02776 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4P02776 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4P02776 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4P02776 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4P02776 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4P02776 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4P02776 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4P02776 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4P02776 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4P02776 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4P02776 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4P02776 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4P02776 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4P02776 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4P02776 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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