Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGAP02671 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGAP02671 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGAP02671 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGAP02671 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGAP02671 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGAP02671 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGAP02671 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGAP02671 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGAP02671 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGAP02671 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGAP02671 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGAP02671 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGAP02671 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGAP02671 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGAP02671 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGAP02671 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGAP02671 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGAP02671 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGAP02671 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGAP02671 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGAP02671 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGAP02671 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGAP02671 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGAP02671 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGAP02671 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms