Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOMM40O96008 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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