Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms