Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms