Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms