Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSO75390 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSO75390 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSO75390 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSO75390 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSO75390 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSO75390 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSO75390 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSO75390 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSO75390 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSO75390 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSO75390 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSO75390 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSO75390 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSO75390 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSO75390 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSO75390 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSO75390 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSO75390 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSO75390 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSO75390 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSO75390 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSO75390 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSO75390 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSO75390 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSO75390 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSO75390 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSO75390 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSO75390 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSO75390 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSO75390 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSO75390 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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