Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCRIPO60506 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCRIPO60506 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms