Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms