Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATCO43716 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATCO43716 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATCO43716 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATCO43716 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATCO43716 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GATCO43716 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATCO43716 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATCO43716 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATCO43716 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATCO43716 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms