Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms