Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAA1O43292 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAA1O43292 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms