Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRXO43186 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRXO43186 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRXO43186 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRXO43186 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRXO43186 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRXO43186 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRXO43186 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRXO43186 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRXO43186 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRXO43186 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRXO43186 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRXO43186 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRXO43186 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms