Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN3O15551 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN3O15551 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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