Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBDO15205 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBDO15205 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBDO15205 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBDO15205 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBDO15205 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBDO15205 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBDO15205 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms