Protein–RNA interactions for Protein: O14829

PPEF1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF1O14829 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPEF1O14829 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPEF1O14829 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms