Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
POLR3AO14802 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3AO14802 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms