Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AGRNO00468 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AGRNO00468 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AGRNO00468 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AGRNO00468 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AGRNO00468 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AGRNO00468 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms