Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms