Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DEV8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DEV8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms