Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms