Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BECN2A8MW95 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms