Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC169A6NNP5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms