Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms