Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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CHD4Q14839 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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CHD4Q14839 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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CHD4Q14839 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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CHD4Q14839 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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CHD4Q14839 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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CHD4Q14839 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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