Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPTBN1Q01082 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms