Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC016705.2-202ENST00000559008 6878 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 GOLGA8B-201ENST00000342314 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 SLC22A10-203ENST00000526800 699 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC026464.1-202ENST00000564737 722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 CEP57-201ENST00000325486 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 IGSF22-205ENST00000513874 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 SPIN3-218ENST00000639007 4277 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC004156.1-201ENST00000591866 3319 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 BNIPL-203ENST00000368931 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 FOXP1-209ENST00000475937 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 CEP57-202ENST00000325542 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 RDH11-201ENST00000381346 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 KIF26B-201ENST00000366518 12113 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 CHKB-CPT1B-202ENST00000453634 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRHP20396 ZNF33A-208ENST00000628825 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 TRIO-201ENST00000344135 4065 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 ZNF812P-202ENST00000536819 1890 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 CSGALNACT1-201ENST00000332246 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 BTK-210ENST00000621635 2767 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 OR8G1-202ENST00000641972 5055 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 STXBP5L-205ENST00000472879 3067 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 TMEM35A-201ENST00000372930 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 PSMF1-203ENST00000335877 4290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 FPR3-202ENST00000595991 2222 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 SHTN1-207ENST00000615301 6730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms