Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms