Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ANKRD40Q6AI12 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms