Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 NUDCD1-201ENST00000239690 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SCN11A-201ENST00000302328 6500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 FN1-204ENST00000356005 7846 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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HERC1Q15751 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC092130.1-201ENST00000565531 531 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZNF471-202ENST00000591537 5859 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MYH2-201ENST00000245503 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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HERC1Q15751 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ANKRD50-201ENST00000504087 8794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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HERC1Q15751 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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HERC1Q15751 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
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HERC1Q15751 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
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HERC1Q15751 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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