Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZBTB20-AS1-203ENST00000475939 1687 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC105101.1-201ENST00000623698 2873 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 PARP9-205ENST00000477522 3128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 TMPRSS11B-201ENST00000332644 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 TM4SF1-201ENST00000305366 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 IL2RB-201ENST00000216223 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AP001042.1-201ENST00000416842 487 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC00489-201ENST00000457816 543 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC004801.2-201ENST00000468202 779 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RN7SL464P-201ENST00000492743 297 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 NR1I3-226ENST00000508740 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC091839.1-201ENST00000513087 269 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC02365-203ENST00000522554 802 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 OR6M3P-201ENST00000531567 700 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC135388.1-201ENST00000536512 353 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC067735.1-201ENST00000551152 526 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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MKRN3Q13064 AC087393.3-201ENST00000584971 166 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 OR7E122P-202ENST00000641144 6171 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 MAPK10-260ENST00000641047 2546 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 GOLGA8B-201ENST00000342314 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC093616.1-201ENST00000427434 2095 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 COX10-AS1-201ENST00000423323 3000 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LDB2-202ENST00000441778 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 BRDT-205ENST00000399546 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 HHAT-203ENST00000367010 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 BUB1B-202ENST00000412359 3628 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ADAM3A-208ENST00000495171 2284 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 HHAT-204ENST00000413764 3575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 DPF3-203ENST00000541685 4077 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 MTRR-201ENST00000264668 3274 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ZNF80-203ENST00000619534 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 DCAF4-212ENST00000553457 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 FRMD6-201ENST00000344768 2972 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ACTBP13-201ENST00000423971 3959 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ADGRF4-203ENST00000371220 3075 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 VTRNA1-2-201ENST00000365241 89 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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