Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 SFR1-201ENST00000369727 1438 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC018541.1-201ENST00000517706 764 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC022639.1-204ENST00000520365 569 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC099687.1-201ENST00000531798 510 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC053513.1-201ENST00000543604 738 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL050343.1-203ENST00000586761 1290 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 IZUMO3-203ENST00000604921 743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RN7SL820P-201ENST00000616437 299 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms