Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3714-201ENST00000579507 65 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC093063.1-201ENST00000599317 363 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 YTHDF2P1-201ENST00000604759 1271 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01396-201ENST00000609099 527 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 STRADA-246ENST00000640397 1045 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC116351.1-201ENST00000399869 3482 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CYFIP2-210ENST00000522463 3477 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC130464.1-201ENST00000416201 1500 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 GIMAP2-201ENST00000223293 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC068512.1-201ENST00000584542 1811 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 COPS4-201ENST00000264389 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 THNSL1-202ENST00000524413 3788 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO38-201ENST00000296701 3680 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OR13H1-201ENST00000338616 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL161787.1-201ENST00000401543 174 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CCNYL3-201ENST00000407030 998 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LYSMD1-202ENST00000440902 1003 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC084809.2-201ENST00000444464 512 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00265-202ENST00000448955 468 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 C15orf40-202ENST00000451195 518 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC009022.1-201ENST00000472115 496 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC026254.1-201ENST00000479473 431 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL272P-201ENST00000487762 289 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC090835.1-201ENST00000515189 1024 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 IGHVII-78-1-201ENST00000521105 269 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC104031.1-201ENST00000527726 372 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4682-201ENST00000580643 80 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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