Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 WFDC8-201ENST00000289953 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 IL37-202ENST00000311328 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 IL37-205ENST00000353225 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 OR2T4-201ENST00000366473 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RNA5SP297-201ENST00000391029 113 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01392-201ENST00000419883 565 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC091730.1-201ENST00000440455 692 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL590648.3-201ENST00000446962 473 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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VAMP3Q15836 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RPL10P19-203ENST00000522289 663 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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VAMP3Q15836 AL157955.2-202ENST00000553921 467 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL132719.1-201ENST00000554515 423 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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VAMP3Q15836 AL050343.1-203ENST00000586761 1290 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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VAMP3Q15836 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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VAMP3Q15836 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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VAMP3Q15836 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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VAMP3Q15836 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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VAMP3Q15836 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PAX8-AS1-213ENST00000609210 1328 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PRAC1-201ENST00000290294 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RNA5SP71-201ENST00000362967 126 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CST13P-201ENST00000376992 428 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RFKP1-201ENST00000400940 428 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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