Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
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CNGB1Q14028 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
CNGB1Q14028 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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CNGB1Q14028 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
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CNGB1Q14028 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
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CNGB1Q14028 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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CNGB1Q14028 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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CNGB1Q14028 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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CNGB1Q14028 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC8.07□□□□□ -1.12
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