Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RPL23AP90-201ENST00000603820 236 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC016705.2-202ENST00000559008 6878 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC110769.2-201ENST00000602760 1548 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC023283.1-201ENST00000453491 4897 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 BACE1-202ENST00000392937 5155 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 FAT1-201ENST00000441802 14786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ABLIM1-206ENST00000392952 6841 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ATMIN-206ENST00000566488 5343 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CLIP1-218ENST00000545889 4633 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SH3YL1-202ENST00000402632 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ALPK1-203ENST00000458497 5410 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ADAM21P1-201ENST00000529267 2170 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 VSIG1-202ENST00000415430 3236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ENOX1-AS1-201ENST00000444442 3907 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ACVR2A-207ENST00000535787 5166 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CTAGE9-201ENST00000314099 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 PROX1-AS1-201ENST00000413560 496 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC244157.1-201ENST00000415642 163 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL354732.1-204ENST00000421020 755 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 MTAPP2-201ENST00000437063 832 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 WDR82P1-201ENST00000439836 939 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 PA2G4P4-201ENST00000473864 1182 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC138356.2-201ENST00000521192 667 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC090568.2-203ENST00000521433 579 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC02028-221ENST00000622169 621 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 PPP3R2-202ENST00000636434 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC00598-212ENST00000637124 905 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC00410-201ENST00000419272 2018 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 TTC23-202ENST00000394129 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ZNF701-201ENST00000301093 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ABHD18-201ENST00000388795 5450 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC010680.2-201ENST00000603521 2117 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 FBXO36-201ENST00000283946 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ABCA17P-204ENST00000494925 3478 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ENPP6-201ENST00000296741 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RORB-202ENST00000396204 2996 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC000036.1-201ENST00000449652 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ZNF252P-208ENST00000592792 2485 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL358473.1-202ENST00000458003 3496 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 NLRP3-204ENST00000366497 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 UBE2N-205ENST00000550657 3018 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AIFM1-205ENST00000460436 1925 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 TBX5-AS1-201ENST00000528549 3620 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.6 ms