Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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