Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 LINC02549-201ENST00000445346 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 EFCAB2-207ENST00000447569 527 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC098679.3-203ENST00000514881 919 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC064807.3-201ENST00000523810 470 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 OR4F28P-201ENST00000559128 938 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC064805.1-203ENST00000577560 526 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 OR4F8P-201ENST00000589943 937 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC073263.3-201ENST00000624449 858 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 LINC02034-201ENST00000635368 760 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 FGL2-202ENST00000637771 989 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 C1orf146-202ENST00000370375 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 CBWD1-207ENST00000382447 1241 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 RN7SL508P-201ENST00000464472 303 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 EFCAB10-204ENST00000485614 799 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC110760.2-202ENST00000507517 946 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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