Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CYP1A1-205ENST00000564596 988 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC020661.5-201ENST00000624853 1854 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 HMGCLL1-201ENST00000274901 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 SORL1-211ENST00000532694 3692 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 OR1D2-203ENST00000641833 4887 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 LRTOMT-202ENST00000307198 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 NLRP3-202ENST00000348069 3828 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 SMC6-207ENST00000448223 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AL049543.1-201ENST00000499525 2874 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 PPP4R1-203ENST00000400556 3925 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM169-201ENST00000295658 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CHN2-211ENST00000424025 2279 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 U91328.2-201ENST00000606723 4130 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ERC1-213ENST00000543086 9241 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC000036.1-201ENST00000449652 2030 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 RPGRIP1-213ENST00000557771 3870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC011632.1-202ENST00000518128 2810 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC092683.1-204ENST00000610408 2830 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC159540.2-202ENST00000613749 2830 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 NCEH1-206ENST00000543711 4062 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AP000977.1-201ENST00000501964 2908 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 EIF4BP5-201ENST00000567338 1795 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ZSCAN23-201ENST00000289788 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC004147.2-201ENST00000583224 3753 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 KLF5-205ENST00000539231 2951 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms