Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms