Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ERG-201ENST00000288319 4919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SLC30A8-201ENST00000427715 5430 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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RYR3Q15413 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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RYR3Q15413 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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RYR3Q15413 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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RYR3Q15413 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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RYR3Q15413 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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RYR3Q15413 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC008938.1-201ENST00000566929 6510 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ZNF772-201ENST00000343280 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MPP7-203ENST00000375732 5063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 PAX6-231ENST00000606377 6901 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ICA1L-222ENST00000617388 8151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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