Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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IFT88Q13099 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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IFT88Q13099 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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