Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AP000787.3-201ENST00000634407 307 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 C2orf42-205ENST00000420306 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 MAGOHB-201ENST00000320756 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 CEP57-201ENST00000325486 3098 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 TNIP3-203ENST00000507879 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 TUBB-205ENST00000327892 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 MSH2-202ENST00000406134 3628 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 SIMC1-201ENST00000332772 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 LOXHD1-212ENST00000582408 3755 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AC090983.1-201ENST00000623426 3897 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 ERG-210ENST00000442448 5034 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 LINC00467-201ENST00000423222 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 MOBP-202ENST00000383754 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 GUCY1A3-208ENST00000511507 2552 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 AP003469.4-201ENST00000565617 2825 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 LINC00598-212ENST00000637124 905 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 TRPM3-211ENST00000396280 4671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 MOSPD1-203ENST00000370783 2364 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 BRPF1-206ENST00000457855 4308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 CSF3R-203ENST00000373103 3454 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 ZIM3-201ENST00000269834 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 MAPK10-252ENST00000640970 2620 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 GNG2-201ENST00000335281 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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