Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 VCAN-208ENST00000512590 5923 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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