Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.3 ms