Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRFP10586 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms