Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ITGB6-211ENST00000620391 4401 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ATXN1-202ENST00000436367 10587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ABCA8-203ENST00000430352 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ZSCAN29-202ENST00000396976 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ANO3-201ENST00000256737 6642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ZAN-205ENST00000613979 8669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 SORBS2-209ENST00000418609 5529 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 COL25A1-209ENST00000622134 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 GREB1L-209ENST00000580732 8749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 EMP1-201ENST00000256951 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 PECAM1-203ENST00000563924 6831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 IL22RA2-201ENST00000296980 2886 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 TNFSF15-202ENST00000374045 6687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AFF2-205ENST00000370460 13746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 VCAN-208ENST00000512590 5923 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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